Нет, зачищать можно, когда угодно. Квестов на зачистку стоянок нет. Есть квест у Андре на сбор рисунков с изображением ГГ, многие из которых находятся в этих лагерях. Чтобы не было душно и сложно, всем этим можно заняться, например, в конце 2 главы, иначе, если заняться этим рано, ведьмы могут доставить большие неприятности неподготовленному герою.